决定因素分岔出现在主线任务“审判日”的神经矩阵控制台前，帮助百灵鸟逃跑或帮助李德抓住她，会开始完全不同的终章任务。两条路线在末尾各有一次生死选择，组合成四种往日之影大结局。只有让百灵鸟活着落入新美国手中的两种结局，才会放开V接受治疗的“高塔”。

想在同一人物档查看全部剧情，看到两项帮助对象的选项时先手动存档。存档要留在选择之前，由于百灵鸟线会进入“比远方更远”，李德线则要故事追捕和“直到大厦崩塌”，只在终章存档无法跨回另一条路线。两条线抵达各自最后抉择前，再分别留档即可补齐四项国王成就。

选择帮助百灵鸟逃跑后，V会跟她冲出体育场，后续等待联络便能接到“比远方更远”。闯入太空港并护送她登上列车后，百灵鸟会承认神经矩阵的治疗机会只有一次，她原本准备把它留给自己。此处叫李德过来，或继续抱起百灵鸟走给航天飞机，都会把剧情带到停机坪，但真正决定大结局的是和李德对峙时的处理。

坚持送百灵鸟去月球，需要放下她后回绝交人，并在限时选项出现时拔枪射杀李德。迟迟不拔枪、继续逼近或有失开火时机都会被李德击毙；成功后可在尸体旁拾取不朽技术手枪“弃子”，再把百灵鸟送上航天飞机，解开“权杖国王”。

若在列车上联系李德，或到了停机坪后收起武器并把百灵鸟交给他，会解开“宝剑国王”。想保留治疗资格，交人时应明确标准李德兑现救治V的承诺；百灵鸟会被活着带走，李德也能继续安排手术。这个分支不标准杀死李德，之后仍可回夜之城活动主题，等他的电话再推进“高塔”。

在“审判日”改选帮助李德抓人，V会启动破冰程序，百灵鸟随即失控逃离，亚历克斯也无法从体育场脱身。V要追踪车队、对付暴恐机动队，再进入军用科技的地下设施。里面的维修机器人无法靠常规火力击杀，听见它靠近时应关掉扫描，利用房间和立柱绕开，强行对射只会被处决。

抵达核心后，百灵鸟请求V结束她的生活。答应并执行安乐死，带出去的只会是遗体，新美国也会撤回治疗承诺，对应“圣杯国王”。此路满足了百灵鸟不愿再受控制的最后标准，但V无法通过神经矩阵摆脱Relic，之后只能继续选择本体原有的终局路线。

回绝杀死百灵鸟并把她活着带出核心，对应“钱币国王”。对话中不要确认执行她的请求，应选择不言败她的选项，直到V明确回绝动手；随后李德会接管百灵鸟，新美国保留对V履约的条件。这条路线同样能够解开“高塔”，而且不必重打太空港对峙。

“宝剑国王”和“钱币国王”结束后，先离开任务区域并消磨一些游戏内时刻，李德会来电说明治疗安排。电话没有立即出现时，可以跳过二十四小时、完成一段街头活动主题后继续等待，不必重做最终选择。收到后续任务并前往米丝蒂通灵屋楼顶，呼叫李德的运输机便会进入新的主线终局。

楼顶呼叫是不可返回点，未完成的委托、恋爱支线和装备整理应在通话前处理。登机接受手术会直接转入“高塔”：Relic被移除，强尼也随之消失，V在两年昏迷后醒来。手术虽然保住了性命，却令神经体系无法继续承受战斗义体，多数旧友的生活也已发生变化，V不再适合回到原来的佣兵生涯。

四种DLC大结局并不会自动覆盖全部本体大结局。“权杖国王”和“圣杯国王”结束后，仍可回到“夜曲”前继续选择荒坂、帕南、罗格或已满足条件的其他路线；获取治疗资格也不等于必须马上接受手术。若想保留放开全球进度，就在楼顶呼叫前另存一档，再决定让V接受“高塔”，还是回去完成夜之城剩余事务。